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5.DNA序列分析:在DGGE分析中检出p53变异条带的样本需进一步进行DNA序列分析。大约100 ng纯化后的PCR片断被作为模板加到20 μl DNA序列分析反应液中(Perkin Elmer, USA),反应液含3.2×10-12 mol/L和DGGE同样的引物。分别经95℃ 30秒,50℃ 15秒,60℃ 4分钟25个周期处理后,酒精沉淀产物,沉淀物再被溶解于25 μl的template suppression reagent (Perkin Elmer)内,在ABI PRISMTM310自动基因序列分析仪中分析。每一样本均分别进行正向和反向两个方向的检测。当一个肿瘤标本有一个以上的p53变异时,需再重复一次全部反应过程(包括DNA扩增,PCR片断的提纯以及序列分析),以排除假阳性。
6.p53免疫组化染色:石蜡切片脱蜡至水化,微波炉处理5分钟后,用ABC法染色(p53单克隆抗体为DO-7,1∶500稀释),DAB显色,苏木素复染,于普通显微镜下观察。阳性核染色的细胞>5%者,被视为阳性[1]。
7.统计学处理:用t检验检测变异碱基峰/正常峰在原发灶和转移灶的比值。p53变异与p53过度表达相关性的检测以Chisquare检测法处理。P值>0.05者为差异有显著性。
结 果
1.p53变异分析:DGGE和序列分析结果见图1。在34例受检患者中,2例PCR失败。剩余32例中,19例(59.4%)在p53外显子5~9发现变异,其中14例显示大肠原发灶和肝转移灶为相同的变异,5例显示p53变异仅发生于肝转移组织;另有2例原发灶即有p53变异的患者,在转移灶除保留原有变异外,还出现了新增加的变异(表2)。在原发、转移灶共37处p53变异中,73.0%(27/37)是错义突变,16.2(6/37)为无义突变,4处插入突变。在所有点变异中,主要为G→A和C→T碱基转换,只有6例为碱基颠换。

1:野生型p53;2:大肠标本,可见p53变异的条带;3:肝转移标本,可见加深的p53变异的条带
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